Nếp là một trong những thành phần chính làm nên Rượu Chuối Hột Phú Lễ. Vì thế, chọn nếp là bước rất quan trọng. Nếp được chọn là Nếp mùa Ba Tri, loại nếp dẻo thơm bậc nhất đồng bằng sông Cửu Long. Nếp được nấu thành cơm, để nguội thì rắc hồ men vào, trộn đều rồi đưa vào xô sạch để ủ. Chờ ba ngày cho cơm nếp và men đã thấm nhuần, hòa quyện vào nhau cho hương nồng đặc trưng thì cho nước vào theo tỉ lệ thích hợp và ủ tiếp. Đến khi ủ đủ bảy ngày đêm là lúc cơm rượu đã đạt độ chín, sẽ đem đi nấu rượu.